PCR实验室分为四个单独的工作区域：试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区、扩增产物分析区。为避免交叉污染，进入各个工作区域严格遵循单一方向进行。各试验区之间的试剂及样品传递应通过传递窗进行。
试剂准备区→标本制备区→扩增区→产物分析区
PCR基本建设
1.主体结构：主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金R50内圆角铝，从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固，线条简明，美观大方，密封性好；
2.标准的四区分隔和气压调节：将PCR过程分成试剂准备、标本制备和扩增区、产物分析四个独立的实验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区，同时各区通过气压调节，使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染；
3.消毒：系统内配置离子消毒模块，对空气中自然菌的有效消亡率应达到99%以上；在各个实验区和各个缓冲区顶部以及传送窗内部安装紫外线杀菌灯，供物体表面照射消毒；
4.不锈钢传递窗：试剂和标本通过机械连锁不锈钢传递窗传递，保证试剂和标本在传递过程中不受污染，做到人、物分流；
5.地面：地面使用PVC卷材地面或环氧自流坪地面，整体性好。便于进行清扫，耐腐蚀；
6.照明：配置净化灯具，能达到便于清洗、不积尘的特点；
7.净化要求：全送全排的气流组织形式。同时，要严格控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
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